历史公认的秦朝都城是咸阳，即今天的咸阳市。但西安宣称自己才是秦朝都城咸阳，并将秦朝算作定都西安的十三个朝代之一。那么到底是不是这样呢，以下从六个方面分析一下。
一、相关的古籍记载
西安是在唐长安城基础上发展起来的，要证明西安是咸阳，就要证明长安是咸阳。为了证明这一点，经常被提到的记载主要有三项：
1、《史记》中的“长安，故咸阳也。”
这其实是司马迁的一个认知错误。唐朝的《史记正义》已经对其进行了更正说明：“秦咸阳在渭北，长安在渭南，萧何起未央宫处也。” 可见了解长安城的唐朝人并不认可司马迁的说法。
2、《旧唐书·地理志》中的“京师，秦之咸阳，汉之长安也。隋开皇二年，自汉长安故城东南移二十里置新都，今京师是也。”
这里提到咸阳和长安只是在解释京师的含义，并不是说咸阳就是长安。
3、《三辅皇图》中的“渭水贯都，以象天汉；横桥南渡，以法牵牛。南有长乐宫，北有咸阳宫，欲通二宫之间，故造此桥。”
《三辅皇图》原本已经失传，今本的来源说不清楚，也不知道是谁编纂的。这样的书作为论据并不可靠，仅仅只能作为参考。
可见除了司马迁的认知错误，并没有真正的古籍证明长安就是咸阳。
二、秦朝的正宫和离宫
秦咸阳城在渭河北岸，属今咸阳市范围。都城里的咸阳宫一直是秦帝国的大朝正宫，秦朝的政治中心和国家象征。而西安市在渭河南岸，境内只有一些秦咸阳城的离宫，类似于北京的颐和园，只不过颐和园的绿化面积更大。虽然考古未发现秦咸阳城的城墙，只是用沟壕为界。但不接壤的离宫并不算是都城的一部分，这是基本常识。渭河南岸的离宫中，著名的阿房宫已经被考古证实并没有完工。另外比较有名的是章台宫，汉未央宫就是在其基础上建立的。
然而据史书记载，秦朝在关中盆地有多达三百个离宫，数量多到几乎现在的每个关中城市都有秦离宫。照葫芦画瓢的话，这些城市也都可以声称自己是秦朝都城。
秦咸阳城及其周边
三、秦朝的朝宫
朝宫是皇帝上朝听政的正式宫殿，作为朝宫的一般都是都城的正宫。有人说渭河南岸的章台宫是秦始皇的朝宫，并用以证明都城咸阳是横跨渭河两岸的，渭河南岸才是秦朝的政治活动中心。这么说有什么历史依据吗？
首先说明，秦王和秦朝的皇帝是完全不同的概念。秦王是东周战国时期的诸侯王，而秦始皇才是秦朝的皇帝。（秦朝二世而亡，只有秦始皇和秦二世两个皇帝）
《史记·苏秦列传》的“今乃欲西面而事秦，则诸侯莫不西面而朝于章台之下矣。”《史记·楚世家》的“西至咸阳，朝章台，如蕃臣”。《史记·廉颇蔺相如列传》的“秦王坐章台见相如，相如奉璧奏秦王。” 这些史实都发生在秦朝前的东周战国时期，只能证明章台宫曾经是东周诸侯国秦国的朝宫，并不能证明章台宫是秦朝的朝宫。
事实上，当嬴政成为最后一位秦王时，仍然把咸阳城里的咸阳宫作为自己的朝宫。著名的荆轲刺秦王的故事就发生在咸阳宫。 据《战国策·燕策三》记载：“秦王闻之，大喜。乃朝服，设九宾，见燕使者咸阳宫。” 由此可见，秦王嬴政是在咸阳宫召见荆轲的，当时的朝宫依然是正宫咸阳宫。
到了秦朝，《史记》记载秦始皇“听事，群臣受决事，悉于咸阳宫”。之后秦二世也仍以渭北秦咸阳城为其政治活动中心。他最后被逼自杀于望夷宫，也是在渭北。
四、秦朝的宗庙
皇室的宗庙一般位于都城内，比如明清时期北京城的太庙。而秦朝的宗庙位于渭河南岸，《史记·秦始皇本纪》就记载：“诸庙及章台、上林皆在渭南。” 这是否就能证明渭南区域也属于咸阳城呢？
了解宗庙文化时看到一篇文章，其中有这样一段文字：“祖先崇拜观念发展到秦朝出现了很大的变化，祖先崇拜在秦文化体系中位置低下，秦人既不重视、也不提倡祖先崇拜。除此之外，还认为逝去祖先的亡魂会化为厉鬼，危害世间，这大抵是缘于秦人不慕往世，只重视现实的缘故。他们把对理想的实现寄托在开疆扩土之上，而不是依靠祖先的庇佑和福荫，但秦人仍有设立宗庙，奉祀祖先的传统，但这种传统也是出于维系统治的需要。”
由此可见，秦人对宗庙的态度是不同于后世的，秦国建造咸阳城时将宗庙放于城外很正常，毕竟让“厉鬼”离得越远越好。
到了秦朝，统治者对于宗庙的观念有所改变。“秦朝宗庙是中国古代宗庙建设的过渡期，上承殷周之传统，下启汉唐之先声。” 但是由于祖宗宗庙都位于渭南，为了和祖宗宗庙在一起，秦始皇也只能将自己的宗庙信宫建在渭河南岸。
五、项羽火烧咸阳城的问题
秦都咸阳被项羽放火烧了三个月，整个咸阳城被毁，变成一片瓦砾。所以西汉建立之初，丞相萧何在渭河南岸的离宫章台宫的基础上修建了未央宫，将另一座离宫兴乐宫改建为长乐宫，进而建起了汉长安城。可见渭河南岸的秦离宫并未被火烧及彻底破坏。
而项羽之所以火烧咸阳城，目的就是要彻底毁掉秦朝的都城，为何还要留下渭河南岸的离宫？
答案只有一个，就是项羽认为这些离宫并不是都城咸阳，没有烧掉的意义。
六、关于行政区域变化
历史上关中地区行政区域多次变化，最典型的是明朝，当时长安和咸阳同属于西安府。而现在的西安市和明朝的西安府仅仅是名字相同而已，行政区划上要小得多，并不包括咸阳。
而西安和咸阳合作建立的西咸新区，其范围包括了秦咸阳城所在区域，由西安管理。所以西安就曲线救国成为秦朝都城了？当然不是。珠海横琴岛即使交给澳门管理了，横琴岛也不真正属于澳门。并且将来西安和咸阳无论市区多么接近，合并的可能性都不大，这一点可以参考广州和佛山。当然，行政区划将来会不会发生变化还不好说。如果将来咸阳市变成西安的咸阳区，一切就另当别论了。
综上所述，秦朝的都城是现在的咸阳市，并不是西安。即使在承认非正统朝代的情况下，西安也只是十二朝古都。
