马来西亚宪法保障宗教自由，但规定伊斯兰教（回教）逊尼派为国教。根据2010年人口和房屋普查的数据，约61.3%的人口信奉回教；19.8%人口为佛教徒；9.1%基督徒6.3%人为印度教徒；1.3%人为儒家、道教和其它传统的华人民间宗信仰追随者。其它则是包括几种信仰，包括泛灵论、民间宗教和锡克教；而1.1%的人没有任何宗教或没有提供任何讯息。
依据马来西亚宪法第160条，所有的马来人被认定为信仰伊斯兰教的穆斯林。2010年人口普查的统计数据显示，在华人人口当中，83.6%登记为佛教徒，接下来是基督宗教（11.1%），道教还有其他华人民间信仰则是（3.4%）。在某些区域例如槟城，也有较小规模的伊斯兰教社群。大部分的印度人信奉印度教（86.2%），接下来是基督宗教（6.0%）、伊斯兰教（4.1%，信奉伊斯兰教的印度人一般被称为为“mamak”）等等。在非马来的原住民社群中，主要宗教是伊斯兰教（46.5%）和基督教（40.4%），没有宗教信仰的人有4%，道教和其他华人民间宗教有3.9%等。
回教徒在宗教事务方面，必须遵守伊斯兰法庭的各项决定。伊斯兰教法官将按照沙斐仪派的法律学派，这是马来西亚主要的麦兹海布。
伊斯兰法庭的司法管辖权只限于穆斯林事务，如婚姻、继承、离婚、叛教、改宗和监护权等。伊斯兰法庭具有类似于马来西亚法院的层次结构，但它并不管辖其他刑事或民事罪行。尽管民事法院（包括联邦法院）是此地最高层级的法律机构，但它们并不审理有关伊斯兰习俗的事项。
